Кроме Никольского собора, на территории Изборской крепости располагалась деревянная церковь Сергия Радонежского и Никадра Псковского. Она была построена сразу после присоединения Пскова к Москве в честь двух святых: Сергия - покровителя и заступника Москвы и Никандра - псковского пустынника. В самом названии храма нашла отражение поддержка идеи единения земель.
В одном из этих пожаров церковь сгорела. Новый каменный храм во имя этих святых изборяне возвели уже на посаде неподалеку от Никольского захаба. Точная дата его постройки неизвестна. В стене храма была обнаружена забеленная вкладная доска с надписью о его постройке в 1611 году. На вкладном камне есть надпись, что церковь построена в 1779 году. Церковь имеет двускатную железную кровлю. Над коньком кровли возвышается небольшая декоративная главка. Храм состоит из двух частей - главной части и притвора с одной апсидой. Главную композиционную роль в оформлении фасада здания играет двухпролетная звонница. В ее основании находится сквозной арочный проем, ведущий внутрь храма. Интересны также церковные ворота - небольшие, с одним арочным проемом - трапецевидная ниша для иконы. За воротами расположено небольшое прицерковное кладбище.
До 1831 года церковь Сергия и Никандра имела свой приход и священника с дьяконом, а затем была приписана к Никольскому собору. В 1963 году этот храм был закрыт и через год передан народному Изборскому музею.